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馬祖列島位於台灣海峽西北方，由南竿、北竿、東莒、西莒、東引、 西引、大坵、高登、亮島等三十餘個島礁組成，臨近海域寒暖海 流交會， 漁產豐饒，為海洋迴游生物棲息繁衍場所，且地處東亞候鳥 遷徙路線上， 因此每年皆有大量沿大陸邊緣遷徙之野鳥於本區繁殖、 渡冬與過境。其 中於「馬祖列島燕鷗保護區」範圍內，每年夏天皆有 成千上萬的燕鷗於 此繁殖，其中以鳳頭燕鷗佔最大宗(Thalasseusbergii)，而最稀有的莫過於 名列紅皮書極危(IUCN 2012)的黑嘴端鳳頭 燕鷗(T. bernsteini)，為連江地 區重要的鳥類資源。