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本保育計畫回顧臺灣海域鯨豚名錄與國際保育分級及已知的分布情形，列出目前鯨豚所受到的主要威脅：獵捕與買賣、混獲與漁具纏繞、海洋污染與廢棄物、水下噪音、船隻撞擊等現況，並提出減輕威脅的可能解決方案，以健康棲地及穩定族群為目標，確保其存續。