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海洋保育署在呼應聯合國「2030 年永續發展目標」，依據《海洋基本法》及行政院「向海致敬」政策，期以科學研究為基礎，規劃並循序執行各項行動方案，經由「公私協力」，以「潔淨海洋」、「健康棲地」、「永續資源」為目標，達成海洋永續利用的願景。