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國家圖書館所保存的善本書以宋、元、明、清善本為主，總計寫本、刻本凡12,000餘部，近13萬冊。內容包含古典文學、史學及哲學，近8千部之刻本中，宋版174部、金版5部、元版230部、明版6,000多部，嘉興大藏經1部，其餘為活字版，清代以及朝鮮、日本、安南流傳較稀之刻本。如以冊計算，善本古籍加上普通線裝書古籍，約有善本舊籍中文260,760冊、西文4,296冊，合計265,056冊。至2016年底統計，其中宋元本珍籍約400餘部。除此之外，本館所藏6,000多部明版書，以及明清稿本和批校本古籍，更為海內外學界所推重，咸認為是研究中華古文化重要資產。