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置主任委員一名，副主任委員三名，主任秘書一名。目前置委員20人，包含行政院政務委員、行政院秘書長、財政部部長、經濟部部長、交通部部長、勞動部部長、行政院農業委員會主任委員、衛生福利部部長、行政院環境保護署署長、文化部部長、國家科學及技術委員會主任委員、金融監督管理委員會主任委員、原住民族委員會主任委員、客家委員會主任委員、行政院主計總處主計長、中央銀行總裁、內政部部長、教育部部長、行政院公共工程委員會主任委員、數位發展部部長。國發會組織下設有綜合規劃處、經濟發展處、社會發展處、產業發展處、人力發展處、國土區域離島發展處、管制考核處、法制協調處、秘書室、人事室、政風室、主計室、資訊室以及國會及新聞聯絡中心、中興新村活化專案辦公室2任務編組，另設有1所屬機關國家發展委員會檔案管理局。